肠道菌群与健康关系密切，它能够维持正常菌群的稳定，保护机体抵抗外来细菌；参与机体代谢，产生短链脂肪酸、维生素K、维生素B等多种重要的营养物质；可以促进免疫器官发育，促使免疫应答及时建立。
而调节肠道菌群就从正确补充益生菌开始
人体到底需要多少益生菌一直是科学家们研究和争论的焦点。不过，大多都赞同每日摄入益生菌的量取决于补充益生菌的目的，越来越多的益生菌研究者或者机构会通过动物预临床实验和临床试验对益生菌起效的剂量进行反复验证。而我们平时可以通过适当选择一些含有多种益生菌的食物来摄取益生菌。一般来说牛奶、谷物、蔬菜和水果发酵后会产生大量细菌。很多发酵的食物，比如奶酪、酸奶甚至泡菜等里，都含有一定量的益生菌。
服用益生菌对肠道起一定保护作用，肠道菌群有助于预防、监控和干预由肠道菌群失调引发的免疫低下、肥胖、肠炎等疾病。肠道微生物菌群中的有益菌，如：双歧杆菌、乳酸杆菌等，是人体健康不可缺少的要素，可合成各种维生素，参与食物消化，促进肠道蠕动，抑制致病菌群的生长，分解有害、有毒物质等。在最大程度上抑制有害细菌的繁殖，减少它们的数量，从而促进肠道健康。使发生肠道功能紊乱或其他肠道疾病的可能性大大降低。益生菌可通过与致病菌竞争占位，竞争营养成分，而其代谢产物可抑制致病菌的生长，从而对肠道起到一定保护作用。
选用益生菌时注意3要点：
1.活性
益生菌必须是“活的”，才能起到健康作用，这是益生菌产生功效的基础。益生菌是有生命活力的微生物，从生产(包括菌种的筛选、生产环境、包装等)、在货架待售、食用后通过胃酸、胆汁等极端环境到达肠道——这层层考验均会消耗益生菌的活性，只有通过这些关卡并最终在肠道定点繁殖存活的益生菌才能真正发挥作用。
2.数量
益生菌的需要量与肠道正常菌群缺失的程度和有害菌的存在数量有关。每天19—20亿益生菌被认为是维持肠道正常菌群的最低限。目前我国乳酸菌标准也明确规定，酸奶中活菌的数量需达到每毫升万个，否则，就不能保证最终到达大肠的活菌量。
3.菌种
益生菌的功效是以“菌株”为准的，并非所有菌种益生菌都具有一样的功效。
肠胃肩负着人体营养吸收和废物排出的功能，胃肠道受损将影响营养的吸收，从而无法保证身体各个器官的营养摄入导致人体机能衰退引发其他疾病。而且肠道中的细菌和有害物质不能及时排出，就会反复被血液吸收，直接影响人体的健康。因此，保持肠道健康关系到生命的质量。