植物病害多种多样，有细菌性病害，真菌性病害和病毒性病害。细菌、真菌的名称中均有一个“菌”字，同属微生物；而病毒介于生物与非生物之间，没有细胞结构，只有核衣壳，即蛋白质外壳和一个核酸分子构成的非细胞形态的营寄生生活的生命体；三者在生物类型、结构、大小、增殖方式和名称上却有着诸多不同。下面介绍下三者的区别，具体比较如下：
生物类型上的区别
1、细胞结构：是否有成形的细胞核。
细菌没有核膜包围形成的细胞核，属于原核生物；真菌有核膜包围形成的细胞核，属于真核生物。病毒没有细胞结构，只有核衣壳。
2、细胞数目：组成生物的细胞数目。
细菌全部是由单个细胞构成，为单细胞型生物；真菌既有由单个细胞构成的单细胞型生物（如酵母菌），也有由多个细胞构成的多细胞型生物（如食用菌、霉菌等）。
细胞结构上的区别
细胞结构细菌和真菌都具有细胞结构，属于细胞型生物，在它们的细胞结构中都具有细胞壁、细胞膜、细胞质，但却存在诸多不同，具体表现在：
1、细胞壁的成分不同：
细菌细胞壁的主要成分是肽聚糖，而真菌细胞壁的主要成分是几丁质（壳多糖）；
2、细胞质中的细胞器组成不同：
细菌只有核糖体一种细胞器；而真菌除具有核糖体外，还有内质网、高尔基体、线粒体、中心体等多种细胞器。
3、细胞内细胞核存在形式不同：
细菌没有成形的细胞核，只有拟核；真菌具有成形的细胞核。
4、细胞内遗传物质不同：
细菌没有染色体，其DNA分子单独存在；真菌细胞核中的DNA与蛋白质结合在一起形成染色体（染色质）。
细胞大小的区别
细胞大小：原核细胞一般较小，直径一般为1μm-10μm；真核细胞较大，直径一般为10μm~μm。病毒个体微小，测量病毒大小的单位是毫微米（nm），即1/0微米。病毒的大小一般在几十到几百nm之间。
菌体增殖方式的区别
细菌是原核生物，为单细胞型生物，通过细胞分裂而增殖，具有原核生物增殖的特有方式，即二分裂方式；真菌为真核生物，细胞的增殖主要通过有丝分裂进行，因真菌种类的不同其个体增殖方式主要有出芽生殖（如酵母菌）和孢子生殖（食用菌）等方式。而病毒则通过自我复制的方式进行增殖。
菌体名称的区别
尽管在细菌和真菌的名称中都有一个菌字，但细菌的名称中一般含有：球、杆、弧、螺旋等描述细菌形态的字眼，只有乳酸菌例外（实为乳酸杆菌）；而真菌名称中则不含有。
病症的区别
1、真菌性病害
真菌性病害是个庞大的家族，在蔬菜上出现的约有0种，常见的有种左右，占整个蔬菜病害的80%，所以看到一种病害首先要考虑其是不是真菌性病害。真菌病害是目前已知病害中种类最多的病害，约占病害种类的80%-90%，
主要表现为：坏死与腐烂，萎蔫与畸形，在病斑上常有两个特征常有一是病斑存在于植株的各个部位，病斑形状有圆形、椭圆形、多角形、轮纹形或不定形。二是病斑上一定有不同颜色的霉状物、粉状物、粒状物或病原菌子实体，颜色有白、黑、红、灰、褐等。
真菌性病害的类型、种类繁多，引起的病害症状也千变万化。但是，凡属真菌性病害，无论发生在什么部位，症状表现如何，在潮湿的条件下都有菌丝、孢子产生。这是判断真菌性病害的主要依据。真菌病害症状的出现时间不一，有的病害初期就出现明显的病症，有的在病害的后期才出现病症，有的病害的初期症状与后期症状相似，有的病害初期和后期症状差别很大。这些特点在真菌病害鉴定上起着决定性作用。因此在真菌病害标本采集时真菌必须要有完整的病害症状。
常见的真菌性病害有，炭疽病类、霜霉病类、叶斑病类、锈病类、白粉病类、根腐类、疫病类、猝倒病类、赤霉病类、纹枯病、立枯病类、疮痂病类等。
2、细菌性病害
在蔬菜上出现的细菌性病害约有种，常见的有余种，占整个蔬菜病害的10%左右。从外部形态来看，蔬菜细菌性病害主要有以下４个方面的特征：
（1）叶片病斑无霉状物或粉状物。长不长毛是真菌性病害与细菌性病害的重要区别。黄瓜细菌性角斑病与霜霉病症状相似，叶片都出现多角形病斑，容易混淆，湿时病斑上长有黑色的霉，而角斑病则没有。
（2）根茎腐烂出现黏液，即菌脓流出，并发出臭味。有臭味为细菌性病害的重要特征，如大白菜软腐病。
（3）果实溃疡或疮痂，果面有小突起。例如番茄溃疡病、辣椒疮痂病。
（4）根部青枯，根尖端维管束变成褐色。例如辣椒青枯病。
常见的细菌性病害有：软腐病、溃疡病、青枯病、细菌性褐斑病、细菌性角斑病、柑桔溃疡病、菊花根癌病等。
3、病毒性病害
蔬菜病毒性病害有种左右，常见的有50种左右，约占整个蔬菜病害的5%。其特点有：种类少；危害大，能使蔬菜减产3-5成，重则绝产，为蔬菜的毁灭性病害；分布广，几乎所有植物都有病毒病，甚至一种植物同时有1-4种病毒病；防治难，无特效药。一般新叶首先出现症状，然后扩展至植株的其他部位，有3种外部表现：
（1）花叶表现为叶片皱缩，有黄绿相间的花斑。黄色的花叶特别鲜艳，绿色的花叶为深绿色。黄色部位都往下凹，绿色部位往上凸。
（2）厥叶表现为叶片细长，叶脉上冲，重者呈线状。
（3）卷叶表现为叶片扭曲，向内弯卷。为害果实的蔬菜病毒性病害，主要表现在成熟期果实上有条斑。例如番茄条斑型病毒病，在果肩部出现青白色，后渐变成铁锈色。用刀剖开果实，皮里肉外有褐色条纹。再如辣椒条斑型病毒病，从果实的尖端向上变黄色，在变黄的部位上有短的褐色条纹，且向内凹陷。
绝大多数病毒都是系统侵染，引起的坏死斑点通常比较均匀的分布在植株上，产生矮化、丛枝、畸形溃疡等特殊症状。植物病毒主要通过昆虫等生物介体来传播，所以预防病毒病，一方面要培育无病毒植株，另一方面要预防虫害的传播。
常见的病毒性病害有：烟草花叶病毒病、番茄花叶病毒病、辣椒花叶病毒病、小麦花叶病毒病、水稻黑条矮缩病、番茄病毒病、烟草病毒病等。
在治疗和预防细菌性、真菌性和病毒性病害时，需根据病症，判断病害，则药而施。针对真菌、细菌性病害时，可以选择甲霜锰锌和乙蒜素等，能有效预防霜霉病、疫病及多种土传病害；针对病毒性病害时，可以选择氨基寡糖素、盐酸吗啉胍、吗呱乙酸铜、香菇多糖、氯溴异氰尿酸等。
不管是真菌性、细菌性还是病毒性病害，在防控上，需要农业管理与药剂防治相结合，及时补充作物所需养分，健壮植株，提高植株本身对病菌的抵抗能力（施用玛斯肽），控制化学合成药剂的使用，保证农产品的安全，