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TUhjnbcbe - 2021/8/31 9:13:00

‘纳什是一个不正常的人’,他总是出现幻觉,是个精神分裂的病人,他总是不停的计算计算,他很难有朋友,他的亲人也无法理解他。然而他实际上是个伟大的数学家,他有着最纯粹最美丽的心灵,他执着,他纯粹,他专注,他用所有的时间与热情证明了一个重要的数学定理。

他是历史上第一个广为人知的“用自己的精神战胜了自己的精神病”的人。

——选自《美丽心灵》豆瓣影评

上周末小编在家看了豆瓣评分8.9的电影《美丽心灵》,该影片讲述一位患有精神分裂症但是在博弈论和微积分几何学领域潜心研究,最终获得诺贝尔经济学奖的数学家约翰.福布斯.纳什的故事,我的心灵受到深深的撼动并被它征服。

作为一个努力向上的五好小青年,我看完电影就立刻打开NCBI研读了一篇关于精神分裂症的文章。电影介绍给你们,文章研究思路也给你们了,讲究吧~

研究背景

精神分裂症(SCZ)是一种具有复杂遗传病因的神经精神疾病。基于和精神分裂症(SCZ)相关基因网络的冗余表明许多基因重组有可能引起系统功能障碍,其可表现为精神分裂症(SCZ)或相关的神经发育障碍。最近的研究表明,小非编码microRNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)是构成这些网络的重要因素,并且通过神经元激活动态调节。

研究材料

22名精神分裂症患者以及24个健康对照样本,提取组织总RNA建库测序进行测序分析。

实验结果

平均每个样本的reads测序深度为M,进行过滤之后得到平均M数据。

精神分裂症(SCZ)相关miRNA分析

从27个个体样本(13个病例和14个对照)数据中进行小RNA-seq数据分析,差异表达分析鉴定出17个统计学上显着差异表达的miRNA(下表)。17个中有10个是新发现的,其余7个与先前精神分裂症(SCZ)和/或其他精神病学有联系的表型,包括miRNA家族34的两个成员,mir-34c,-34a(p值分别为3e.4和0.02)及许多其他成员,包括mirs-,-,-,-和-。

基于RNA-seq的miRNA分析

虽然RNA-seq目的不是用于系统地检测miRNA的表达变化,但是一些与RNA相关的miRNA可通过RNA-seq检测到。如材料和方法部分中所述的GTF文件的结果发现,SCZ患者和健康对照之间的MIR的差异表达情况。MIR的表达在对照中高于患者约三倍(p值=0.)。这种差异表达情况在smallRNA侧吸的数据中也出现了同样的结果。

基于RNA-seq的lncRNA分析

转录组数据差异分析,鉴定出个lncRNA在患者和健康人之间发生显著差异表达,在所有差异表达的lncRNA中,发现有两个lncRNA,lncRNAsRP11-N1.1(pvalue=0.)和RP11-M14.2(pvalue=0.)。这两个lncRNA与之前基于GWAS筛选出的SCZ相关区域有关。其中lncRNAsRP11-N1.1位于chr10的基因座内,之前已有多项研究表明该区域与SCZ相关。lncRP11-M14.2位于与SCZ相关的神经粒蛋白基因内。

SCZ亚型相关分析

基于病人的临床亚型,进一步把SCZ病人分为精神紊乱(7人),偏执狂(5人)和未分化的(9人)。在lncRNA表达水平分析揭示亚型特异性。与未分化的临床亚型相比,MIR在对照中显示出高10倍的表达,与偏执亚型相比,增加了2倍。MIR在偏执亚型中表现出显着更高的表达。同时,研究还鉴定了先前报道与SCZ或其他精神疾病相关的miRNA表达的亚型特异性。miRNA家族34仅在未分化表型患者中表达显著,而mir-仅与紊乱型相关。

研究结论

SCZ脑中小RNA的差异表达分析鉴定了可能有助于疾病发病机理的多个基因。将差异表达的smallRNA和lncRNA与先前报道的GWAS研究中鉴定的基因座交互分析,找出两个显著差异的基因miRNA(mir)和lncRNAs(AC.2),它们在SCZ患者张的差异表达有助于观察到在这些微店的GWAS信号信息。该研究证明了相关疾病组织的转录分析在鉴定GWAS信号的基因中的效用。

参考文献:Liuetal.Non-codingRNAdysregulationintheamygdalaregionofschizophreniapatientscontributestothepathogenesisofthedisease.TranslationalPsychiatry()8:44

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